Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms