Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRB1P82279 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRB1P82279 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRB1P82279 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRB1P82279 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRB1P82279 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRB1P82279 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRB1P82279 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms