Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS13P62277 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS13P62277 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS13P62277 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS13P62277 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS13P62277 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS13P62277 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS13P62277 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS13P62277 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS13P62277 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms