Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDL3P58872 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms