Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms