Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD23BP54727 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD23BP54727 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAD23BP54727 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD23BP54727 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms