Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSEN2P49810 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms