Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms