Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms