Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms