Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRIM23P36406 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms