Protein–RNA interactions for Protein: P28370

SMARCA1, Probable global transcription activator SNF2L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA1P28370 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA1P28370 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms