Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB3P14651 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms