Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms