Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI1P08151 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI1P08151 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI1P08151 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI1P08151 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI1P08151 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI1P08151 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI1P08151 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI1P08151 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI1P08151 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms