Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms