Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBA3O96018 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBA3O96018 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APBA3O96018 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APBA3O96018 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
APBA3O96018 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
APBA3O96018 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APBA3O96018 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBA3O96018 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA3O96018 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA3O96018 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA3O96018 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA3O96018 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA3O96018 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA3O96018 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA3O96018 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA3O96018 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBA3O96018 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBA3O96018 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBA3O96018 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA3O96018 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA3O96018 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA3O96018 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA3O96018 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA3O96018 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA3O96018 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBA3O96018 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms