Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CUX2O14529 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CUX2O14529 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CUX2O14529 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CUX2O14529 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CUX2O14529 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CUX2O14529 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CUX2O14529 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUX2O14529 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CUX2O14529 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUX2O14529 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUX2O14529 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CUX2O14529 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CUX2O14529 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CUX2O14529 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CUX2O14529 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CUX2O14529 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CUX2O14529 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CUX2O14529 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CUX2O14529 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CUX2O14529 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CUX2O14529 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CUX2O14529 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CUX2O14529 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CUX2O14529 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CUX2O14529 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CUX2O14529 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CUX2O14529 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CUX2O14529 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CUX2O14529 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms