Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGRNO00468 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AGRNO00468 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AGRNO00468 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AGRNO00468 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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