Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC78A2IDD5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms