Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc166S4R181 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc166S4R181 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc166S4R181 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc166S4R181 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc166S4R181 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc166S4R181 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc166S4R181 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc166S4R181 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc166S4R181 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc166S4R181 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc166S4R181 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc166S4R181 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc166S4R181 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc166S4R181 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms