Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2X1

Hnrnpf, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpfQ9Z2X1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HnrnpfQ9Z2X1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HnrnpfQ9Z2X1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpfQ9Z2X1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpfQ9Z2X1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpfQ9Z2X1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HnrnpfQ9Z2X1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HnrnpfQ9Z2X1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HnrnpfQ9Z2X1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HnrnpfQ9Z2X1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HnrnpfQ9Z2X1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HnrnpfQ9Z2X1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HnrnpfQ9Z2X1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HnrnpfQ9Z2X1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HnrnpfQ9Z2X1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms