Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mrpl40Q9Z2Q5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms