Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knop1Q9Z2Q2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Knop1Q9Z2Q2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knop1Q9Z2Q2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knop1Q9Z2Q2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Knop1Q9Z2Q2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms