Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tulp1Q9Z273 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tulp1Q9Z273 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tulp1Q9Z273 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tulp1Q9Z273 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tulp1Q9Z273 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tulp1Q9Z273 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms