Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc45Q9Z1X9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc45Q9Z1X9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc45Q9Z1X9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc45Q9Z1X9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc45Q9Z1X9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc45Q9Z1X9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc45Q9Z1X9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc45Q9Z1X9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc45Q9Z1X9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc45Q9Z1X9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdc45Q9Z1X9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc45Q9Z1X9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc45Q9Z1X9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdc45Q9Z1X9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc45Q9Z1X9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc45Q9Z1X9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc45Q9Z1X9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc45Q9Z1X9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc45Q9Z1X9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc45Q9Z1X9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms