Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Thbs4Q9Z1T2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Thbs4Q9Z1T2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Thbs4Q9Z1T2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Thbs4Q9Z1T2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Thbs4Q9Z1T2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Thbs4Q9Z1T2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Thbs4Q9Z1T2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Thbs4Q9Z1T2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,2 ms