Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d3Q9Z1L5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms