Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nek4Q9Z1J2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nek4Q9Z1J2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nek4Q9Z1J2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nek4Q9Z1J2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nek4Q9Z1J2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nek4Q9Z1J2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek4Q9Z1J2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nek4Q9Z1J2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nek4Q9Z1J2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms