Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Stxbp4Q9WV89 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Stxbp4Q9WV89 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Stxbp4Q9WV89 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Stxbp4Q9WV89 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Stxbp4Q9WV89 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Stxbp4Q9WV89 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Stxbp4Q9WV89 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Stxbp4Q9WV89 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,1 ms