Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx1Q9WV80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx1Q9WV80 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx1Q9WV80 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx1Q9WV80 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx1Q9WV80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx1Q9WV80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx1Q9WV80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx1Q9WV80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx1Q9WV80 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx1Q9WV80 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx1Q9WV80 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx1Q9WV80 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx1Q9WV80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx1Q9WV80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx1Q9WV80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms