Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VapaQ9WV55 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VapaQ9WV55 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VapaQ9WV55 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VapaQ9WV55 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VapaQ9WV55 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapaQ9WV55 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VapaQ9WV55 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VapaQ9WV55 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VapaQ9WV55 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VapaQ9WV55 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VapaQ9WV55 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VapaQ9WV55 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VapaQ9WV55 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms