Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnni1Q9WUZ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni1Q9WUZ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni1Q9WUZ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni1Q9WUZ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni1Q9WUZ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnni1Q9WUZ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnni1Q9WUZ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni1Q9WUZ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnni1Q9WUZ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms