Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF2

Egr4, Early growth response protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr4Q9WUF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Egr4Q9WUF2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Egr4Q9WUF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Egr4Q9WUF2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Egr4Q9WUF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Egr4Q9WUF2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Egr4Q9WUF2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Egr4Q9WUF2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Egr4Q9WUF2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms