Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClcnkbQ9WUB6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClcnkbQ9WUB6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClcnkbQ9WUB6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ClcnkbQ9WUB6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ClcnkbQ9WUB6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.7 ms