Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh13Q9WTR5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh13Q9WTR5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh13Q9WTR5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh13Q9WTR5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh13Q9WTR5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh13Q9WTR5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh13Q9WTR5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms