Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nfe2l3Q9WTM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nfe2l3Q9WTM4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nfe2l3Q9WTM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfe2l3Q9WTM4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms