Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc2Q9R244 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc2Q9R244 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trpc2Q9R244 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc2Q9R244 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc2Q9R244 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc2Q9R244 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms