Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sae1Q9R1T2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sae1Q9R1T2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sae1Q9R1T2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sae1Q9R1T2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sae1Q9R1T2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sae1Q9R1T2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sae1Q9R1T2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sae1Q9R1T2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sae1Q9R1T2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sae1Q9R1T2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sae1Q9R1T2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sae1Q9R1T2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sae1Q9R1T2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sae1Q9R1T2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms