Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syt9Q9R0N9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syt9Q9R0N9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syt9Q9R0N9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syt9Q9R0N9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syt9Q9R0N9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syt9Q9R0N9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syt9Q9R0N9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms