Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd164Q9R0L9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd164Q9R0L9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd164Q9R0L9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms