Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek3Q9R0A5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nek3Q9R0A5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nek3Q9R0A5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nek3Q9R0A5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek3Q9R0A5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nek3Q9R0A5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek3Q9R0A5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek3Q9R0A5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms