Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gpc1Q9QZF2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpc1Q9QZF2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpc1Q9QZF2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpc1Q9QZF2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc1Q9QZF2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms