Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fscn3Q9QXW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fscn3Q9QXW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Fscn3Q9QXW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fscn3Q9QXW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fscn3Q9QXW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fscn3Q9QXW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fscn3Q9QXW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fscn3Q9QXW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fscn3Q9QXW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fscn3Q9QXW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fscn3Q9QXW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms