Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clca3a1Q9QX15 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3a1Q9QX15 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3a1Q9QX15 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3a1Q9QX15 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3a1Q9QX15 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3a1Q9QX15 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3a1Q9QX15 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3a1Q9QX15 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3a1Q9QX15 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca3a1Q9QX15 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3a1Q9QX15 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3a1Q9QX15 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3a1Q9QX15 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca3a1Q9QX15 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.7 ms