Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyth1Q9QX11 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyth1Q9QX11 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyth1Q9QX11 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyth1Q9QX11 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyth1Q9QX11 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyth1Q9QX11 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms