Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr4Q9QUK6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr4Q9QUK6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr4Q9QUK6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr4Q9QUK6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlr4Q9QUK6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr4Q9QUK6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr4Q9QUK6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr4Q9QUK6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr4Q9QUK6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr4Q9QUK6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr4Q9QUK6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr4Q9QUK6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr4Q9QUK6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr4Q9QUK6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr4Q9QUK6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr4Q9QUK6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr4Q9QUK6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr4Q9QUK6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr4Q9QUK6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr4Q9QUK6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr4Q9QUK6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms