Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SigirrQ9JLZ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SigirrQ9JLZ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SigirrQ9JLZ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SigirrQ9JLZ8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SigirrQ9JLZ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SigirrQ9JLZ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SigirrQ9JLZ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SigirrQ9JLZ8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms