Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LitafQ9JLJ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LitafQ9JLJ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LitafQ9JLJ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LitafQ9JLJ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LitafQ9JLJ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LitafQ9JLJ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LitafQ9JLJ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LitafQ9JLJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LitafQ9JLJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LitafQ9JLJ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LitafQ9JLJ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms