Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr5Q9JLF7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr5Q9JLF7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr5Q9JLF7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr5Q9JLF7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr5Q9JLF7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr5Q9JLF7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr5Q9JLF7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tlr5Q9JLF7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr5Q9JLF7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlr5Q9JLF7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlr5Q9JLF7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlr5Q9JLF7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlr5Q9JLF7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tlr5Q9JLF7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlr5Q9JLF7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlr5Q9JLF7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlr5Q9JLF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms